Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spta1P08032 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spta1P08032 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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