Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TnfP06804 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TnfP06804 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TnfP06804 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TnfP06804 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TnfP06804 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TnfP06804 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TnfP06804 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TnfP06804 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TnfP06804 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TnfP06804 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TnfP06804 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TnfP06804 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TnfP06804 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnfP06804 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnfP06804 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnfP06804 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnfP06804 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnfP06804 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnfP06804 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnfP06804 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnfP06804 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TnfP06804 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TnfP06804 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnfP06804 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnfP06804 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnfP06804 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnfP06804 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnfP06804 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TnfP06804 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnfP06804 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnfP06804 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnfP06804 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnfP06804 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnfP06804 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnfP06804 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnfP06804 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnfP06804 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnfP06804 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnfP06804 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnfP06804 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnfP06804 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnfP06804 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnfP06804 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnfP06804 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnfP06804 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnfP06804 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TnfP06804 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TnfP06804 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms