Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06324 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06324 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06324 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06324 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06324 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06324 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06324 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06324 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06324 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06324 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06324 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06324 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06324 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06324 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06324 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06324 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06324 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06324 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06324 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06324 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06324 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06324 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06324 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06324 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06324 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06324 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06324 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06324 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms