Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01669 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01669 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01669 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01669 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01669 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01669 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01669 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms