Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hcn2O88703 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms