Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BlmO88700 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BlmO88700 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BlmO88700 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BlmO88700 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BlmO88700 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BlmO88700 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BlmO88700 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BlmO88700 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BlmO88700 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BlmO88700 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BlmO88700 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BlmO88700 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BlmO88700 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BlmO88700 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BlmO88700 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BlmO88700 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BlmO88700 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BlmO88700 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BlmO88700 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BlmO88700 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BlmO88700 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BlmO88700 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BlmO88700 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BlmO88700 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BlmO88700 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BlmO88700 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BlmO88700 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BlmO88700 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BlmO88700 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BlmO88700 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BlmO88700 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BlmO88700 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BlmO88700 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BlmO88700 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BlmO88700 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BlmO88700 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BlmO88700 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BlmO88700 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BlmO88700 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BlmO88700 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BlmO88700 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BlmO88700 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BlmO88700 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BlmO88700 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BlmO88700 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BlmO88700 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BlmO88700 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BlmO88700 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BlmO88700 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms