Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClppO88696 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClppO88696 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClppO88696 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClppO88696 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClppO88696 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ClppO88696 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClppO88696 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ClppO88696 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClppO88696 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClppO88696 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClppO88696 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClppO88696 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClppO88696 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClppO88696 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClppO88696 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClppO88696 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClppO88696 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClppO88696 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClppO88696 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClppO88696 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClppO88696 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClppO88696 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClppO88696 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClppO88696 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClppO88696 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClppO88696 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClppO88696 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClppO88696 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClppO88696 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClppO88696 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClppO88696 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClppO88696 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClppO88696 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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