Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ComtO88587 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ComtO88587 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ComtO88587 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ComtO88587 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ComtO88587 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ComtO88587 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ComtO88587 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ComtO88587 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ComtO88587 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ComtO88587 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ComtO88587 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ComtO88587 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ComtO88587 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ComtO88587 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ComtO88587 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ComtO88587 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ComtO88587 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ComtO88587 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ComtO88587 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ComtO88587 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ComtO88587 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ComtO88587 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ComtO88587 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ComtO88587 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ComtO88587 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ComtO88587 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ComtO88587 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ComtO88587 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ComtO88587 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms