Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Kcnk4O88454 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Kcnk4O88454 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnk4O88454 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms