Protein–RNA interactions for Protein: O70477

Pknox1, Homeobox protein PKNOX1, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox1O70477 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pknox1O70477 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pknox1O70477 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms