Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CtssO70370 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtssO70370 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtssO70370 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtssO70370 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtssO70370 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtssO70370 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtssO70370 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtssO70370 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtssO70370 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtssO70370 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtssO70370 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtssO70370 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtssO70370 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtssO70370 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtssO70370 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtssO70370 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtssO70370 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtssO70370 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtssO70370 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CtssO70370 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtssO70370 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CtssO70370 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtssO70370 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtssO70370 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtssO70370 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtssO70370 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtssO70370 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtssO70370 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms