Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nptx2O70340 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nptx2O70340 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nptx2O70340 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx2O70340 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx2O70340 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx2O70340 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx2O70340 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx2O70340 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx2O70340 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx2O70340 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx2O70340 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx2O70340 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx2O70340 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx2O70340 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx2O70340 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nptx2O70340 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms