Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itgb5O70309 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms