Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxq1O70220 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms