Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms