Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChkbO55229 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChkbO55229 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChkbO55229 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChkbO55229 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms