Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cbx4O55187 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms