Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Rpl35aO55142 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Rpl35aO55142 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rpl35aO55142 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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