Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eif6O55135 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif6O55135 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif6O55135 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif6O55135 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif6O55135 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eif6O55135 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms