Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyp26a1O55127 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms