Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap2O55126 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap2O55126 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms