Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BckdkO55028 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BckdkO55028 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BckdkO55028 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BckdkO55028 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BckdkO55028 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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BckdkO55028 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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BckdkO55028 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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BckdkO55028 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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BckdkO55028 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BckdkO55028 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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