Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc3O55013 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3O55013 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms