Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlkO54988 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlkO54988 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlkO54988 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlkO54988 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlkO54988 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlkO54988 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlkO54988 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlkO54988 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlkO54988 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlkO54988 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlkO54988 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlkO54988 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlkO54988 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlkO54988 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlkO54988 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlkO54988 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlkO54988 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlkO54988 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlkO54988 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlkO54988 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlkO54988 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlkO54988 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlkO54988 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlkO54988 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlkO54988 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlkO54988 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlkO54988 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlkO54988 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SlkO54988 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlkO54988 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlkO54988 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlkO54988 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlkO54988 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlkO54988 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SlkO54988 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SlkO54988 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SlkO54988 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms