Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnk2O54967 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnk2O54967 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnk2O54967 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnk2O54967 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnk2O54967 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnk2O54967 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnk2O54967 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnk2O54967 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnk2O54967 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnk2O54967 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnk2O54967 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnk2O54967 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnk2O54967 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms