Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LatO54957 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LatO54957 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LatO54957 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LatO54957 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms