Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb3O54890 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itgb3O54890 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms