Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk2a2O54833 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms