Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DffaO54786 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DffaO54786 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DffaO54786 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DffaO54786 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DffaO54786 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DffaO54786 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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DffaO54786 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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DffaO54786 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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DffaO54786 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DffaO54786 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DffaO54786 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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