Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Sdc4O35988 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc4O35988 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms