Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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FxnO35943 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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FxnO35943 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FxnO35943 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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FxnO35943 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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FxnO35943 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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FxnO35943 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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FxnO35943 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FxnO35943 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FxnO35943 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FxnO35943 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FxnO35943 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FxnO35943 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FxnO35943 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FxnO35943 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FxnO35943 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FxnO35943 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FxnO35943 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FxnO35943 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FxnO35943 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FxnO35943 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FxnO35943 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms