Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Lhx8O35652 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Ccl20-203ENSMUST00000186832 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Lhx8O35652 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lhx8O35652 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx8O35652 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms