Protein–RNA interactions for Protein: O35609

Scamp3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp3O35609 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scamp3O35609 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scamp3O35609 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms