Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edil3O35474 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Edil3O35474 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms