Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccrl2O35457 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccrl2O35457 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccrl2O35457 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccrl2O35457 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccrl2O35457 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccrl2O35457 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccrl2O35457 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms