Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnih1O35372 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cnih1O35372 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cnih1O35372 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnih1O35372 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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