Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KeraO35367 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KeraO35367 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KeraO35367 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KeraO35367 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KeraO35367 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KeraO35367 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KeraO35367 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KeraO35367 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KeraO35367 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KeraO35367 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KeraO35367 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KeraO35367 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KeraO35367 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KeraO35367 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KeraO35367 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms