Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkd2O35245 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms