Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smad6O35182 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms