Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms