Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn4O35054 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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