Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha8O09127 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha8O09127 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms