Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
U90926O08546 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
U90926O08546 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
U90926O08546 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
U90926O08546 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
U90926O08546 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
U90926O08546 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
U90926O08546 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
U90926O08546 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms