Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3542K7N6U2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3542K7N6U2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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