Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccer2J3QPU5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccer2J3QPU5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms