Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5849J3QPE5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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