Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm8356J3QPD3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm8356J3QPD3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm8356J3QPD3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm8356J3QPD3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm8356J3QPD3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm8356J3QPD3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm8356J3QPD3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm8356J3QPD3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm8356J3QPD3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm8356J3QPD3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm8356J3QPD3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm8356J3QPD3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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