Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 91 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim22J3QP37 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms