Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc180J3QNE4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc180J3QNE4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms