Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm21972J3QN38 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms